云南自考考生完成专业考试计划规定的全部课程考试，成绩合格，并完成毕业论文（设计）或其他教学实践任务后，可申请办理毕业证书，以下是具体流程：

申请条件：
1. 考完专业考试计划规定的全部课程，成绩合格；
2. 完成毕业论文（设计）或其他教学实践任务，成绩合格；
3. 申请本科毕业证书的考生，需具有国家承认的专科及以上学历证书。

申请时间：云南自考毕业申请每年安排两次，上半年一般在5月至6月，下半年一般在11月至12月，具体时间以云南省招生考试院通知为准。

申请流程：
1. 考生登录“云南省招生考试院”官网，进入自学考试毕业申请系统，填写毕业申请信息；
2. 上传相关材料，如身份证、学历证书、照片等；
3. 提交申请后，等待招生考试机构审核；
4. 审核通过后，考生需在规定时间内缴纳毕业审核费；
5. 领取毕业证书，一般在申请结束后2-3个月左右，考生可到指定地点领取或选择邮寄方式。