云南自考本科和专科主要有以下区别：1. 学历层次：专科是高等教育的基础层次，本科是更高层次；2. 考试科目：专科一般考15门左右科目，本科除了15门左右专业科目外，还需要考毕业论文（设计）；3. 毕业条件：专科考完所有科目合格即可申请毕业，本科除了科目合格，还需要有国家承认的专科及以上学历才能申请毕业；4. 学位申请：本科可以申请学士学位，专科没有学位。

报考建议：如果只有高中或中专学历，可以先报考专科，再报考本科，或者选择专本套读；如果已经有专科学历，直接报考本科即可。考生可以根据自己的学历基础和职业规划选择适合的层次。